Kurstillfällen

Hösten 2024

Engelskt kurstillfälle: 21-23/10 + 5/11 (på engelska)
Svenskt kurstillfälle: 18-20/11 + 6/12 (på svenska)

Kursledare

Jan Lexell jan [dot] lexell [at] med [dot] lu [dot] se
Christina Brogårdh christina [dot] brogardh [at] med [dot] lu [dot] se

Målgrupp

Forskningsstudenter vid medicinska fakulteten. Studenter som har gjort sin halvtidskontroll har företräde.

Poäng

1,5 högskolepoäng

Syfte

Kursen syftar till att de forskarstuderande ska fördjupa sina kunskaper och färdigheter i publiceringsprocessen och hur man skriver och granskar ett vetenskapligt manuskript.

Genomförande

Undervisningen sker huvudsakligen genom interaktiva undervisningsmoment. Kursen innehåller föreläsningar, granskning av vetenskapliga artiklar, grupparbeten, diskussioner, praktiska tillämpningar och självstudier. Kursen ges under fem dagar och inleds med tre kursdagar, därefter en dag med eget arbete och avslutas 2 veckor senare med en kursdag.

Kursplan (pdf 66,5 kB, ny flik)

Course dates 

Autumn 2024:

Week 47, 18-22 November. Mornings are in class and the afternoons consist of individual work.

Course organizers 

Matteo Bruschettini matteo [dot] bruschettini [at] med [dot] lu [dot] se (matteo[dot]bruschettini[at]med[dot]lu[dot]se)

Martin Ringsten martin [dot] ringsten [at] med [dot] lu [dot] se (martin[dot]ringsten[at]med[dot]lu[dot]se)

Examinator

Stefan Hansson stefan [dot] hansson [at] med [dot] lu [dot] se (stefan[dot]hansson[at]med[dot]lu[dot]se)

Target group 

The one week course is aimed towards PhD students and researchers at the Faculty of Medicine.
Participation is free for PhD students from European Economic Area (EEA) and Switzerland. Other external participants might require a fee for participation, see more on Cochrane Sweden’s website for this course.

Description

The course is aimed at PhD students and researchers who wants to increase their knowledge about how to conduct a systematic review or evidence synthesis. The course is also relevant for people who will use systematic reviews, evidence synthesis or results from randomized trials to inform decisions in healthcare (clinicians, decision makers, guideline developers, or policy makers).

The course aims to introduce and increase participants knowledge about the Cochrane methodology to systematic reviews with a focus on systematic reviews of interventions. During the week we will go through the process from the initial idea and research question that can be explored in a systematic review, tools to support the systematic review process, risk of bias, meta-analysis, the GRADE-approach to judge uncertainty, best practice reporting of results in reviews, and the use of systematic reviews in guidelines and decision making. 
The course will include lecturers and facilitators from several Cochrane Centers, each within their expert area. Lectures will be mixed with discussions and working in groups with exercises in the mornings, and after lunch participants will work individually within the Cochrane Interactive Learning-modules. There will be time to ask individual questions to our lecturers and facilitators about your own potential reviews or other evidence-related questions during the week.

Location

The course will be aimed to be conducted on campus in Lund for all days.

Examination
To pass the course you will need to attend the days in class, have an active participation in discussions and teamwork during these days, and completion of the module 1-8 and quizzes in Cochrane Interactive Learning.

Credits

The course is rewarded with 1,5 ECTS credits (equal to one week full time studies) for enrolled PhD students. All participants will receive a certificate of attendance for the course.

Resources and literature

Cochrane Interactive Learning modules, available from https://training.cochrane.org/interactivelearning 

Cochrane Handbook for Systematic Reviews of Interventions, available for free from https://training.cochrane.org/handbook

Additional articles, books and some pre-course work will be handed out before the course starts.

Registration

You can register through the link in the right hand margin. Chose the correct date of the course. If you are an external participant (outside of Lund University), please clearly state this and your affiliation and professional title in “Other comments”, and try to fill the other information in as good as possible (if not relevant leave blank)

Kursplan (pdf 289,6, ny flik)

Försöksdjursvetenskap för utförare av djurförsök

Kursansvarig: 

Lena Uller (lena [dot] uller [at] med [dot] lu [dot] se (lena[dot]uller[at]med[dot]lu[dot]se)) Docent, Respiratorisk Immunofarmakologi, Institutionen för experimentell medicinsk vetenskap, Lund

Examinator:

Lena Uller

Målgrupp

Detta är en obligatorisk kurs för doktorander vid Lunds Universitet som avser att arbeta med djur. Du registreras specifikt för de djurslag du avser arbeta med. Inga förkunskaper inom området krävs. Kursen motsvarar FELASA B, men är ännu inte formellt certifierad av Felasa B. 

Poäng

3 högskolepoäng för full kurs, 2 poäng om inte den praktiska delen utförs.

Tid & Lokal

Detta är en web-baserad utbildning som finns på Canvas Catalog. Du arbetar på egen hand vid din egen dator.

Kursinnehåll 

Kursen är på engelska & innehåller 15 moduler, varvat med självutvärderingar.

• Modul 1: Etik och djuranvändning
• Modul 2: Svensk lagstiftning
• Modul 3: Journalföring
• Modul 4: Identifieringsmetoder
• Modul 5: Avbrytningskriterier
• Modul 6: Biologi
• Modul 7: Etologi
• Modul 8: Hushållning
• Modul 9: Djurvård och övervakning
• Modul 10: Anestesi, analgesi och eutanasi
• Modul 11: Sjukdomar hos försöksdjur
• Modul 12: Försöksdjursmetodik
• Modul 13: Genetiskt Modifierade Organismer
• Modul 14: Alternativa metoder
• Modul 15: Säkerhet på biomedicinska avdelningar

Genomförande

Ungefärlig tid för att avsluta den teoretiska delen är 40 h. De olika modulerna examineras kontinuerligt med självutvärderingar. Efter avklarad teori finns det möjlighet till en praktisk del, där omfattningen påverkas av dina inplanerade aktiviteter inom din forskning. Efter detta erhålls ett certifikat på din kunskap om att arbeta med djur.

Kurslitteratur

All litteratur finns på Canvas Catalog med länkar till hemsidor mm för mer information.

För frågor om kursen, vänligen kontakta djurutbildning [at] med [dot] lu [dot] se (djurutbildning[at]med[dot]lu[dot]se) 

Anmälan till kursen: Training in Laboratory Animal Science | Staff Pages (lu.se)

Points: 7.5 hp (fulltime)

Dates: 23^rd September – 25^rd October 2024 (5 weeks)

General information 

The purpose of this course is to give a deeper understanding of the links between exposure to environmental pollutants and the occurrence of diseases. This is an online course organized jointly by the Department of Occupational and Environmental Medicine, Lund University, Sweden, and the Department of Public Health, Ponitificia Universidad Catolica de Chile. This course is supported by the STINT and ACCESS program for higher Education, and is open to Ph.D. and Postdocs of ACCESS Universities. 

Course content 

The course aims to provide an overview of human toxicology that links exposure to environmental pollutants with the occurrence of diseases at the populational level. The concepts of toxicology will be introduced by describing how toxic substances (chemicals, metals, toxins, particles) in our daily life can affect the health of people. Routes of exposure will be linked to certain diseases (e.g., inhaling chemicals, and airway diseases). Toxicokinetics, dose response, and routes of exposure will be discussed as well as genetic and epigenetic mechanisms. The students will learn about environmental epidemiology and environmental exposures to chemicals, metals, pesticides, and endocrine disruptors. Concepts such as designs, collection of health data, fieldwork, epidemiological indicators, causality, and epidemiological research questions will be reviewed.

Objective: 

 Upon completion of the course, students shall be able to:

• define basic toxicological concepts applied to environmental chemicals, and explain their importance in the determination of toxicity
• explain mechanisms involved in the toxicity of different substances (chemicals, metals, toxins, particles) and their link to diseases in humans
• explain the importance of other processes involved in the sensitivity to toxic substances and the occurrence of diseases, such as genetic, epigenetic, and other factors observed at the population level
• explain the advantages and limitations of health-related environmental monitoring and biomonitoring
• explain the advantages and limitations of epidemiological studies to evaluate human exposure to toxic substances and the risk of disease
• understand toxicological and epidemiological methods to address environmental problems that may affect health

Schedule:

The course consists of lectures, interactive learning exercises and self-studies. The language of instruction and assessment is English. Lectures will be scheduled for Mondays, Tuesdays, Wednesdays and Thursdays (afternoons in Sweden, mornings in Chile).

Examination and Assessment 

The assessment is based on:

• Individual presentation of a “real case scenario” (4.5 pt). A short presentation by the student about a topic of their own choice related to the course content 
• 3 short knowledge assessments (1.5 pt)
• Active participation in group exercises and group presentation (1.5 pt). Each group will evaluate a different case of environmental pollution (movie + review). 

The grades awarded are Pass or Fail. 

Teachers:

Main Teacher Lund: 

Annette Krais, Department of Occupational and Environmental Medicine, Lund University

annette [dot] krais [at] med [dot] lu [dot] se (annette[dot]krais[at]med[dot]lu[dot]se)

Main Teacher Chile: 

Sandra Cortés, Department of Public Health, Ponitificia Universidad Catolica de Chilescortesn [at] uc [dot] cl (scortesn[at]uc[dot]cl)

Examiner: 

Lars Rylander, professor, Department of Occupational and Environmental Medicine, Lund University (lars [dot] rylander [at] med [dot] lu [dot] se)

Language: The course is given in English

Target group and requirements:

To be admitted to the course, students must be admitted to studies at Lund University. The course is primarily intended for PhD and PostDocs from Medical Faculty that have an interest in toxicology, and that have performed to at least 120 first or second cycle credits in biology or chemistry or similar. English B level is required. No other specific entry requirements apply.

Number of participants: 30

Poäng: 1.5 hp (heltid)

Datum: 13 maj – 17 maj 2024

Introduktion

Kursen ger en bakgrund till problemet ”saknade data” och vilka konsekvenserna av enkla ad-hoc metoder för lösning av detta problem kan bli. För- och nackdelar med olika metoder diskuteras; Fokus på denna kurs är multipel imputation (MI), en metod som deltagarna också får prova på under kursens laborativa delar.

Syfte: Att göra deltagarna medvetna om potentiella konsekvenser av felaktig hantering av saknade data i medicinsk forskning i allmänhet samt att ge dem redskap för korrekt hantering av saknade data i den egna forskningen.

Kursen innehåller följande teman:

• Introduktion till saknade data
  • Att identifiera saknade data
  • Möjliga konsekvenser av saknade data
  • Mekanismer för uppkomst av saknade data
  • Kort översikt av metoder för hantering av saknade data
• Multipel imputation
  • Översiktligt om teorin bakom MI
  • Metoden ”chained equations”
  • Att bygga en imputationsmodell
  • Analys av imputerade data
  • Diagnostik av MI-modellen (modellvalidering)
• Rapportering MI-resultat och metodens begränsningar
  • Riktlinjer för rapportering av analyser av multipel-imputerade data
  • MI-metodens begränsningar

Schema:

Måndag, tisdag (fm), onsdag och fredag (fm) – aktiviteter i klassrummet, tisdag (em) samt torsdag – eget arbete, fredag (em) - examination.

Lärare:

Aleksandra Turkiewicz, docent, CStat, Enheter för klinisk epidemiologi, Kliniska Vetenskaper, Lund

Pär-Ola Bendahl, docent, fil. dr., Institutionen för kliniska vetenskaper Lund, Lunds universitet (par-ola [dot] bendahl [at] med [dot] lu [dot] se (par-ola[dot]bendahl[at]med[dot]lu[dot]se))

Examinator:

Jonas Björk, professor, fil. dr., Institutionen för laboratoriemedicin, Lunds universitet (jonas [dot] bjork [at] med [dot] lu [dot] se (jonas[dot]bjork[at]med[dot]lu[dot]se))

Språk: Engelska

Målgrupp och förkunskaper : Målgruppen är alla doktorander vid medicinska fakulteten som i sina projekt hanterar datamängder med saknade data. I andra hand, och i mån av plats, öppnas kursen upp för post-docs och seniora forskare som önskar lära sig mer om hantering av detta problem. Deltagare måste ha förkunskaper motsvarande tillämpad statistik I och II samt gedigen kunskap i hantering av ett statistiskt programpaket där implementering av multipel imputation finns (t ex R, Stata eller SPSS). Deltagare måste ha teoretisk och praktiskt kunskap om linjära samt logistiska regressionsmodeller.

Antal deltagare: 20

Plats: Lund

• Aktivitetsbalans vid hälsa, ohälsa och sjukdom
• Att samla och använda biobanksprover inom forskning
• Applied Epidemiology and statistics III: Causal inference with non-randomized data (samarbete med GU - apply here for this course)
• Approaches to handling of missing data (samarbete med GU - online course)
• Basic Data Handling and Visualization with R
• Clinical proteomics and biological mass spectrometry
• Complex interventions in health care with a special focus on the care of adults and older persons
• Diabetes research
• Drug development and clinical trials 
• Epidemiology I - Introduction to Epidemiology
• Flödescytometri, Introduktionskurs
• Flödescytometri, Fortsättningskurs
• Glycobiology
• Health and Environment with special focus on climate change and sustainability
• Introduction to programming
• MAX IV/ESS-based imaging for medical and biomedical research, experimental setup
• Medicinsk bioinformatik, introduktionskurs
• Neutron scattering for medical and biomedical research, experimental part.
• Perspektiv på genus och intersektionalitet i medicinsk och hälsovetenskaplig forskning
• Preklinisk avbildning
• Tillämpad epidemiologi och statistik III: Kausal inferens med icke-randomiserad data
• Tillämpad kvalitativ metod II 
• Tillämpad statistik III - Statistiska metoder för upprepade mätningar
• Tillämpad statistik III- Tidsserieanalys i klinisk epidemiologi och miljöepidemiologi
• Tillämpad statistik III - Överlevnadsanalys
• X-ray micro- and nanoimaging for medical and biomedical research, experimental part